Para un correcto mantenimento de los discos duros es necesario realizar una degragmentación periodica. Existen un buen numero de aplicaciones Open Source
JkDefrag v3.36
http://kessels.biz/JkDefrag/
Este es un defragmentador muy simple pero efectivo, realiza todos los pasos simplemente con ejecturar el programa. Analiza, defragmenta y compacta.
Existe una versión más de entorno Windows “My Defrag”
http://www.mydefrag.com/index.html
http://kessels.biz/JkDefrag/
Ultra Defrag
http://ultradefrag.sourceforge.net/index.html
Un programa clasico es el Auslogics Disk Defrag
http://www.auslogics.com/en/software/disk-defrag
Los tres son programas en continua evolución